Este centro antes era conocido como Centro "El Edén“, donde eran recibidos los menores de edad y sus familias que venían retornados desde Estados unidos.
En el 2015 el Gobierno de Honduras inició la remodelación de las instalaciones de dicho centro con fondos propios, sumándose a está gran labor la Organización Internacional para las Migraciones (OIM) con el apoyo económico para dar continuidad al proyecto.
Este Centro fue inaugurado el 08 de febrero de 2016 con el nombre Este Centro es administrado por la Organización Internacional para las Migraciones (OIM), en base al Acuerdo entre la Secretaría de Relaciones Exteriores y Cooperación Internacional y dicho Organismo con el propósito de dar seguimiento al fortalecimiento de las capacidades de atención a niños, niñas y adolescentes retornados del Centro.